日本海上保安厅称之为，6月份及7月中上旬，来自中国的海洋科考船在未取得任何许可的情况下密集经常出现在东海和钓鱼岛周边海域。最多时有3艘中方海洋科考船同时在冲绳近海作业。日本媒体7月23日报导称之为，中方的海洋科考船皆在没取得许可的条件下经常出现在日本的专属经济水域(EEZ)进行海洋调查。

中方海洋科考船在作业时遭日本海上保安厅的阻扰，日方拒绝中方立刻暂停作业，回应中方则对此这是中国海域，科考工作早已取得中国政府的许可。报导援引多名日本政府高官的话称之为，日本政府22日首次得知，这些中国科考船仍然在挖出附近海域的海底淤泥，疑为对东海及钓鱼岛周边海域的大陆架及地质情况做到准确分析，更进一步为中方在东海的海底资源研发寻求不顾一切合法依据。日本海上保安厅说道，6月上旬、中旬、下旬和7月上旬，中方海洋科考船在钓鱼岛周边海域实行作业。7月10日至15日，中方科考船倒数多天经常出现在黄尾屿和赤尾屿以北海域捕食，最少的时候3艘中国科考船同时经常出现在冲绳近海。

日本资源能源局声称，钓鱼岛周边海域海底蕴含金属矿物的可能性很低，中方在此作业的目的应当不是为了资源勘探，而是调查附近海域的地质与中国江河流经大海沙土的联系。我国海洋调查船在钓鱼岛海域展开科学考察，常常遭日方的公然阻扰和警告。今年6月13日，勘407号在钓鱼岛海域科考时也遭日方阻扰。

对中国海洋科考船的海洋调查活动，日本还曾通过外交渠道向中方明确提出调停。在这一问题上，中国外交部多次具体回应，钓鱼岛及其附属岛屿自古以来就是中国的固有领土，中方会拒绝接受日方以钓鱼岛是日本领土为前提展开的任何调停。

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